Використання цих методів залежить від індивідуального клінічного випадку та наявних протипоказань. Наприклад, МРТ– ідеальний метод деталізованої діагностики новоутворень легень, а КТ незамінний для швидкої діагностики пневмоній. МРТ протипоказаний для пацієнтів з металевими конструкціями та кардіостимуляторами, але дозволений вагітним (починаючи з 2 триместру). КТ протипоказаний вагітним, але дозволено практично всім пацієнтам без особливих обмежень.
